9月9—12日，国家发展改革委学术委员会在内蒙古召开2009年度课题研讨会。18个省区市代表参加了会议，以“十二五”规划重大前期课题研究为主题，围绕城乡统筹和城镇化、区域经济、改革开放等多方面问题展开讨论，呈现出涉及面广、研究程度深等新特点。
在城乡统筹和城镇化建设方面，大家认为，要统筹好中国特色新型工业化与中国特色农业现代化，统筹好中国特色城镇化与中国特色社会主义新农村建设，实现城乡经济社会发展的制度一体化。在推进城镇化过程中，要坚持以科学发展观为指导，以改革开放为动力，做到激进式与渐进式并举、政府主导与市场配置结合、新型工业化与新型农业化结合，重点解决产业支撑、城镇化成本、创新城镇管理体制以及资金投入等四大问题。其中，江苏提出结合城乡统筹发展的不同进程，苏南正在形成公平和谐的新型城乡关系，苏中城乡互动发展日趋加速，苏北城市带动农村发展并形成了城市发展区、农民集中区、工业发展区、农业保护区4大区域的规划体系。大连立足自身特点，提出实施城乡一体化发展战略，推动城乡基础设施建设、产业分工、公共管理、人力资源配置和社会保障五个一体化。浙江指出城市化主线是在继续提高经济活动的空间集聚程度的基础上，进一步优化产业布局和城镇体系，提高资源要素的空间利用效率。
在区域经济方面，大家认为，区域协调发展不等同于同质化发展和同构化发展，应该是在各地充分发挥动态比较优势基础上的相对均衡、优势互补和良性互动的发展。在“十二五”期间，关键要落实主体功能区分类管理的体制和政策，推动大经济区发展，基本建立协调发展的机制、基本扭转产业同构的现状、基本形成经济区错位互补发展的分工体系。其中，四川提出建立成渝经济区协调机制，指出川渝合作出现困境的重要原因在于协调机制缺失，建议以跨界治理体系为基本框架，形成投融资、利益分配、合作补偿、评价激励等合作新机制，推动成渝经济区加速发展。陕西提出继续实施区域发展总体战略，加大对陕南陕北贫困地区的扶持，建立健全区域协调互动机制，积极推进城镇化进程，加快主体功能区建设，不断推动各区域协调均衡发展。
在改革开放方面，大家认为，目前中国改革已经进入深水区，过去的改革更多地表现为对制约发展的“松绑”、“解困”，新一轮改革则要在更深层次展开；在金融危机背景下，尤其要坚定扩大开放的决心和信心，寻找新增点和突破口。其中，天津以探索滨海新区综合配套改革为重点，提出大力推进金融创新，加快行政区和功能区整合，全力建设好中新天津生态城等重特大项目，力争用5至10年时间，在滨海新区率先基本建成完善的社会主义市场经济体制，为全国发展改革提供经验和示范。新疆一方面强调“引进来”，吸引更多的生产要素壮大本地经济；另一方面，谋划“走出去”，充分发挥与中亚五国的地缘、亲缘和宗教等优势，加大与中亚五国的经济社会交往力度，努力打造辐射中亚的“桥头堡”。